De volgende soorten lijken sterk op elkaar:
- vingerhoedskruiddwergspanner (Eupithecia pulchellata)
- vlasbekdwergspanner (Eupithecia linariata)
De vingerhoedskruiddwergspanner heeft de volgende kenmerkende eigenschappen die hem van de vlasbekdwergspanner onderscheiden:
- de buitenkant van de middenband is bij de voorrand ingedeukt (zie de pijl op de foto hiernaast);
- de tekening op de voor- en achtervleugel is helder en vrij scherp;
- de vingerhoedskruiddwergspanner (E. pulchellata) is over het algemeen groter dan de vlasbekdwergspanner (E. linariata);
- waardplant: vingerhoedskruid (ook de cultivars).
De vlasbekdwergspanner heeft de volgende kenmerkende eigenschappen die hem van de vingerhoedskruiddwergspanner onderscheiden:
- de buitenkant van de middenband is bij de voorrand niet of nauwelijks ingedeukt (zie de pijl op de foto hiernaast);
- de tekening op de voor- en achtervleugel is vrij flets en minder scherp;
- de vlasbekdwergspanner (E. linariata) is over het algemeen kleiner dan de vingerhoedskruiddwergspanner (E. pulchellata);
- waardplant: vlasleeuwenbekje.

