De Vlinderstichting werkt veel samen met andere organisaties. Want door de krachten te bundelen kan er meer bereikt worden.

Butterfly Conservation Europe (BCE)

Dag- en nachtvlinders gaan overal in Europa sterk achteruit, evenals hun leefgebieden. Daarom is in 2004 Butterfly Conservation Europe opgericht met als doelstellingen het stoppen van de snelle achteruitgang van dag- en nachtvlinders én hun leefgebieden in Europa. Daarnaast worden initiatieven gericht op de bescherming van vlinders en hun leefgebieden gestimuleerd. De partners in BCE zijn naast De Vlinderstichting:
British Butterfly Conservation (Engeland)
Instituut voor Natuur- en Bosonderzoek (België)
Umweltforschungszentrum (Duitsland)

SoortenNL

SoortenNL is een netwerk van organisaties die toegepast onderzoek doen en natuurgegevens verzamelen met hulp van vrijwilligers voor de bescherming van soorten en hun leefgebieden.

Het netwerk is ontstaan uit een samenvoeging van Stichting Veldonderzoek Flora en Fauna (VOFF) en de koepel Soortenbescherming Nederland. Binnen het netwerk wordt o.a. gewerkt aan de Nationale Databank Flora en Fauna, ecologische monitoring en bescherming van soorten en hun leefgebieden.

Nationale Databank Flora en Fauna (NDFF)

Alle waarnemingen van vlinders en libellen worden opgeslagen in de Nationale Databank Flora en Fauna. De Vlinderstichting heeft toegang tot deze databank, zodat snel en eenvoudig waarnemingen kunnen worden opgevraagd.

Centraal Bureau voor de Statistiek (CBS)

Het Landelijk Meetprogramma is sinds 1990 een samenwerking tussen De Vlinderstichting en het Centraal Bureau voor de Statistiek (CBS) met als doel het verzamelen van actuele informatie over de vlinderstand in Nederland.

Nature Today

Nature Today houdt u op de hoogte van de actuele gebeurtenissen in de natuur in Nederland en daarbuiten. Biologen, waaronder de experts van De Vlinderstichting, geven dagelijks informatie over onder andere vlinders, zoogdieren, amfibieën, libellen, planten, zeedieren en vogels.

Vivara Natuurbeschermings-producten

De samenwerking met Vivara Natuurbeschermingsproducten is gericht op het onder de aandacht brengen en versterken van elkaars activiteiten. Daarnaast worden samen producten voor vlinders en insecten ontwikkeld die Vivara in haar assortiment opneemt onder het logo van De Vlinderstichting.

IUCN

IUCN NL is de samenwerkingsorganisatie van de 35 in Nederland gevestigde leden van IUCN. De Vlinderstichting is lid van de IUCN. Er worden projecten uitgevoerd die de brug vormen tussen maatschappelijke organisaties, de overheid, het bedrijfsleven en de wetenschap. Alle projecten hebben te maken hebben met het tegengaan van het verlies aan biodiversiteit.

Werkgroep Vlinderfaunistiek

De Werkgroep Vlinderfaunistiek (WVF) is onderdeel van de Stichting European Invertebrate Survey (EIS) Nederland en bestaat sinds 2002. De werkgroep heeft als doel het verzamelen van zoveel mogelijk betrouwbare gegevens over het voorkomen van vlindersoorten in Nederland, niet alleen van macronachtvlinders, maar ook van microvlinders en dagvlinders. Een bijzondere activiteit van de WVF is het Trekvlinderonderzoek, dat in 1940 gestart is door B.J. Lempke. Ook over de resultaten hiervan wordt jaarlijks gerapporteerd in Entomologische Berichten. 

Sectie Ter Haar van de Nederlandse Entomologische Vereniging 

De doelstelling van de sectie Ter Haar is de kennis over macrovlinders in Nederland te vergroten en toegankelijk te maken voor iedereen. Het zwaartepunt ligt hierbij op nachtvlinders. De sectie houdt ieder jaar twee bijeenkomsten: er wordt kennis uitgewisseld, lezingen gegeven en materiaal getoond. Bovendien wordt jaarlijks, samen met de sectie Snellen (microvlinders), een excursie georganiseerd naar een natuurgebied. 

De sectie ter Haar geeft, wederom samen met de sectie Snellen, tweemaal per jaar het mededelingenblad Franje uit voor alle leden. Een groot aantal leden van de sectie Ter Haar heeft voor een belangrijk deel bijgedragen aan de totstandkoming van de nachtvlindergids, met name op het gebied van de verspreiding en de zeldzaamheid van de soorten. 

Streektuinen

Een streektuin is een tuin die de streekeigen natuur uit jouw omgeving welkom heet en daarmee een (extra) stapsteen vormt voor de lokale biodiversiteit. De Vlinderstichting hielp mee om dit initiatief te ontwikkelen.